Charged aminoacids

Антон, добрый день! Я посмотрел структуры эпитопов с заряженными остатками (mouse-ch_cdr3a_epitope_0_train.sdf). Оказалось, что там есть ошибки в зарядах. В основном заряжен лизин, но не всегда (1-я строка структура содержит лизин (K), но он не заряжен). Проверил несколько структур, не нашел заряды, которые должны быть на заряженных остатках. Проверьте, пожалуйста